Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc175E9PVB3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms