Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms