Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms