Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AU015836B2RUM3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms