Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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