Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms