Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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