Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms