Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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