Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms