Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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