Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm26992S4R1A3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm26992S4R1A3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms