Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac6Q9Z2V5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac6Q9Z2V5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac6Q9Z2V5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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