Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms