Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gipc2Q9Z2H7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gipc2Q9Z2H7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gipc2Q9Z2H7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gipc2Q9Z2H7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gipc2Q9Z2H7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms