Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd1Q9Z2E2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd1Q9Z2E2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms