Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mbd3Q9Z2D8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mbd3Q9Z2D8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms