Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tulp1Q9Z273 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tulp1Q9Z273 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms