Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn8Q9Z260 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms