Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uso1Q9Z1Z0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Uso1Q9Z1Z0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms