Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ap3b1Q9Z1T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms