Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lgr5Q9Z1P4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lgr5Q9Z1P4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms