Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr4Q9Z1L2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms