Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pmfbp1Q9WVQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pmfbp1Q9WVQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pmfbp1Q9WVQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms