Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slit3Q9WVB4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slit3Q9WVB4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms