Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArcQ9WV31 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms