Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim10Q9WUH5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim10Q9WUH5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms