Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc2Q9R244 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc2Q9R244 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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