Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TapbpQ9R233 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms