Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Taf7Q9R1C0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Taf7Q9R1C0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Taf7Q9R1C0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf7Q9R1C0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms