Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr54Q9R0D8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms