Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lamc3Q9R0B6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Lamc3Q9R0B6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lamc3Q9R0B6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms