Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf4Q9QZS2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf4Q9QZS2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf4Q9QZS2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms