Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a3Q9QZS0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3Q9QZS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms