Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms