Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt3Q9QZ47 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms