Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdzd4Q9QY39 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd4Q9QY39 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms