Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snai3Q9QY31 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai3Q9QY31 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms