Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb11Q9QY30 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb11Q9QY30 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms