Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkp3Q9QY23 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp3Q9QY23 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms