Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms