Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nufip1Q9QXX8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nufip1Q9QXX8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms