Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip3Q9QXT8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms