Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim44Q9QXA7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms