Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyhr1Q9QXA1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyhr1Q9QXA1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyhr1Q9QXA1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms