Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer2Q9QWW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms