Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chaf1aQ9QWF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms