Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PdcQ9QW08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PdcQ9QW08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdcQ9QW08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms