Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rai2Q9QVY8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms