Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Trpc4Q9QUQ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Trpc4Q9QUQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Trpc4Q9QUQ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Trpc4Q9QUQ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4Q9QUQ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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Trpc4Q9QUQ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Trpc4Q9QUQ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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